Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCIMPQ6UWF3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCIMPQ6UWF3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCIMPQ6UWF3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms