Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLPSL2Q6UWE3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms