Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC171Q6TFL3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC171Q6TFL3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC171Q6TFL3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms