Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOA5Q6Q788 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOA5Q6Q788 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms