Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC12Q6PEW1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC12Q6PEW1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZCCHC12Q6PEW1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC12Q6PEW1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms