Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF544Q6NX49 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF544Q6NX49 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF544Q6NX49 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms