Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.412e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 BCOR-211ENST00000490976 3480 ntTSL 26.22□□□□□ -1.412e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-217ENST00000519634 589 ntTSL 46.21□□□□□ -1.422e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-208ENST00000518381 487 ntTSL 46.21□□□□□ -1.422e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-214ENST00000519116 562 ntTSL 46.21□□□□□ -1.422e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.422e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.482e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.52e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.532e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CCT5-211ENST00000512975 578 ntTSL 45.31□□□□□ -1.562e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.562e-7■■■■□ 20.4
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NIPBLQ6KC79 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.642e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-239ENST00000523685 694 ntTSL 34.79□□□□□ -1.642e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.732e-7■■■■□ 20.4
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NIPBLQ6KC79 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.842e-7■■■■□ 20.4
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NIPBLQ6KC79 CTNNA1-222ENST00000520400 589 ntTSL 42.5□□□□□ -2.012e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-238ENST00000523298 577 ntTSL 21.96□□□□□ -2.12e-7■■■■□ 20.4
NIPBLQ6KC79 CTNNA1-202ENST00000517533 579 ntTSL 31.8□□□□□ -2.122e-7■■■■□ 20.4
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NIPBLQ6KC79 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.687e-7■■■■□ 20.4
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NIPBLQ6KC79 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 20.2
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NIPBLQ6KC79 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.752e-6■■■■□ 20
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NIPBLQ6KC79 ZBED5-203ENST00000525350 3677 ntTSL 22.3□□□□□ -2.048e-6■■■■□ 20
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NIPBLQ6KC79 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.348e-6■■■■□ 20
NIPBLQ6KC79 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)15.4■□□□□ 0.065e-6■■■■□ 19.9
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NIPBLQ6KC79 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.115e-6■■■■□ 19.9
NIPBLQ6KC79 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.212e-19■■■■□ 19.9
NIPBLQ6KC79 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.372e-19■■■■□ 19.9
NIPBLQ6KC79 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.622e-19■■■■□ 19.9
NIPBLQ6KC79 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)10.93□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 19.9
NIPBLQ6KC79 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 19.9
NIPBLQ6KC79 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 19.9
NIPBLQ6KC79 SAT1-209ENST00000489394 1135 ntTSL 29.85□□□□□ -0.831e-6■■■■□ 19.9
NIPBLQ6KC79 SAT1-206ENST00000463236 735 ntTSL 34.99□□□□□ -1.611e-6■■■■□ 19.9
NIPBLQ6KC79 ZFAS1-210ENST00000623640 732 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.153e-12■■■■□ 19.8
NIPBLQ6KC79 RPS8-204ENST00000470475 981 ntTSL 213.55□□□□□ -0.242e-15■■■■□ 19.8
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NIPBLQ6KC79 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 19.7
NIPBLQ6KC79 IFNAR2-208ENST00000420068 505 ntTSL 515.82■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 19.7
NIPBLQ6KC79 IFNAR2-203ENST00000382238 1127 ntTSL 312.65□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 19.7
NIPBLQ6KC79 IFNAR2-210ENST00000447980 726 ntTSL 510.99□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 19.7
NIPBLQ6KC79 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.763e-6■■■■□ 19.7
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