Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
USPL1Q5W0Q7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USPL1Q5W0Q7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USPL1Q5W0Q7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms