Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CHIC1Q5VXU3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CHIC1Q5VXU3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CHIC1Q5VXU3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms