Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM6

PRAMEF13, Putative PRAME family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF13Q5VWM6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF13Q5VWM6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF13Q5VWM6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF13Q5VWM6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.2 ms