Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOCADQ5VW36 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOCADQ5VW36 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOCADQ5VW36 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms