Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GARNL3Q5VVW2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms