Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2LQ5T4T6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP2LQ5T4T6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms