Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDZK1Q5T2W1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZK1Q5T2W1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZK1Q5T2W1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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