Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATAD3CQ5T2N8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATAD3CQ5T2N8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms