Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPANXN3Q5MJ09 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPANXN3Q5MJ09 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPANXN3Q5MJ09 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms