Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C3orf38Q5JPI3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf38Q5JPI3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms