Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC4Q5GLZ8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC4Q5GLZ8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC4Q5GLZ8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms