Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF542PQ5EBM4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF542PQ5EBM4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms