Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms