Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms