Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C18orf21Q32NC0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C18orf21Q32NC0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms