Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTL8BQ17RB0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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RTL8BQ17RB0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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RTL8BQ17RB0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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RTL8BQ17RB0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RTL8BQ17RB0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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