Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM187BQ17R55 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187BQ17R55 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM187BQ17R55 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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