Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN1Q16799 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RTN1Q16799 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN1Q16799 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN1Q16799 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
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