Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NREPQ16612 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NREPQ16612 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NREPQ16612 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NREPQ16612 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NREPQ16612 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NREPQ16612 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NREPQ16612 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NREPQ16612 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NREPQ16612 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NREPQ16612 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NREPQ16612 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NREPQ16612 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NREPQ16612 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NREPQ16612 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NREPQ16612 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NREPQ16612 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NREPQ16612 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NREPQ16612 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NREPQ16612 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NREPQ16612 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NREPQ16612 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NREPQ16612 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NREPQ16612 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NREPQ16612 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NREPQ16612 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NREPQ16612 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NREPQ16612 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NREPQ16612 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NREPQ16612 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms