Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKN1Q16512 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PKN1Q16512 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms