Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USF2Q15853 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USF2Q15853 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USF2Q15853 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USF2Q15853 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USF2Q15853 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USF2Q15853 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USF2Q15853 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USF2Q15853 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USF2Q15853 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USF2Q15853 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USF2Q15853 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USF2Q15853 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USF2Q15853 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USF2Q15853 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USF2Q15853 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USF2Q15853 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USF2Q15853 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USF2Q15853 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USF2Q15853 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USF2Q15853 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USF2Q15853 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USF2Q15853 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USF2Q15853 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USF2Q15853 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USF2Q15853 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USF2Q15853 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USF2Q15853 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USF2Q15853 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USF2Q15853 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USF2Q15853 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USF2Q15853 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USF2Q15853 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USF2Q15853 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USF2Q15853 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USF2Q15853 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USF2Q15853 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USF2Q15853 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USF2Q15853 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USF2Q15853 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USF2Q15853 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
USF2Q15853 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USF2Q15853 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USF2Q15853 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USF2Q15853 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USF2Q15853 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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