Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLR1Q15399 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR1Q15399 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms