Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDK3Q15120 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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