Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC3Q15034 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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