Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO1Q147U7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO1Q147U7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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