Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HNF4GQ14541 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HNF4GQ14541 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms