Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A6Q14031 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL4A6Q14031 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
COL4A6Q14031 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A6Q14031 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
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