Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCINQ13939 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCINQ13939 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCINQ13939 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCINQ13939 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCINQ13939 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCINQ13939 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCINQ13939 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCINQ13939 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCINQ13939 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCINQ13939 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCINQ13939 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCINQ13939 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCINQ13939 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCINQ13939 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCINQ13939 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCINQ13939 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCINQ13939 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCINQ13939 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCINQ13939 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCINQ13939 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCINQ13939 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCINQ13939 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCINQ13939 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCINQ13939 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCINQ13939 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCINQ13939 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCINQ13939 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCINQ13939 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCINQ13939 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCINQ13939 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCINQ13939 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCINQ13939 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCINQ13939 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCINQ13939 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCINQ13939 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCINQ13939 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCINQ13939 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCINQ13939 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCINQ13939 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCINQ13939 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCINQ13939 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCINQ13939 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCINQ13939 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCINQ13939 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCINQ13939 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCINQ13939 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCINQ13939 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCINQ13939 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCINQ13939 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCINQ13939 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCINQ13939 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCINQ13939 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCINQ13939 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCINQ13939 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCINQ13939 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCINQ13939 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCINQ13939 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCINQ13939 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCINQ13939 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCINQ13939 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCINQ13939 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCINQ13939 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCINQ13939 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCINQ13939 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCINQ13939 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCINQ13939 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCINQ13939 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCINQ13939 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCINQ13939 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCINQ13939 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCINQ13939 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCINQ13939 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCINQ13939 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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