Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA3CQ13748 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA3CQ13748 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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