Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL3Q13618 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL3Q13618 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL3Q13618 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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