Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX6Q13608 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX6Q13608 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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