Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1H3Q13133 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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