Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH17Q12864 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH17Q12864 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH17Q12864 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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