Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TWF1Q12792 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWF1Q12792 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWF1Q12792 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWF1Q12792 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWF1Q12792 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWF1Q12792 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWF1Q12792 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TWF1Q12792 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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