Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NIPAL4Q0D2K0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIPAL4Q0D2K0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPAL4Q0D2K0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms