Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SSRP1Q08945 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSRP1Q08945 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSRP1Q08945 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms