Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCK1Q08629 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCK1Q08629 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms