Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE4DQ08499 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE4DQ08499 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4DQ08499 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms