Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT17Q04695 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT17Q04695 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms