Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YJR012CYJR012C 624 nt6.14□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 APN1YKL114C 1104 nt6.14□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 COX17YLL009C 210 nt6.14□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 RPL3YOR063W 1164 nt6.14□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 HAL1YPR005C 885 nt6.14□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.14□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 PDB1YBR221C 1101 nt6.14□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 DCC1YCL016C 1143 nt6.14□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 VPS5YOR069W 2028 nt6.14□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 DUG1YFR044C 1446 nt6.14□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 RCK1YGL158W 1539 nt6.14□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 GEX2YKR106W 1848 nt6.13□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 IPK1YDR315C 846 nt6.13□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt6.13□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 YJL220WYJL220W 453 nt6.13□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 SET5YHR207C 1581 nt6.12□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 YJL171CYJL171C 1191 nt6.12□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 PFA3YNL326C 1011 nt6.12□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 ODC2YOR222W 924 nt6.12□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 HOS1YPR068C 1413 nt6.12□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 PCS60YBR222C 1632 nt6.12□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 EAF5YEL018W 840 nt6.11□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 PUS6YGR169C 1215 nt6.11□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 COS6YGR295C 1146 nt6.11□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 RPP0YLR340W 939 nt6.11□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 YBL044WYBL044W 369 nt6.11□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 PEX32YBR168W 1242 nt6.11□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 SCT1YBL011W 2280 nt6.11□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 SSK1YLR006C 2139 nt6.11□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 NUP116YMR047C 3342 nt6.1□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 YNL194CYNL194C 906 nt6.1□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 BSC5YNR069C 1470 nt6.09□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 JEM1YJL073W 1938 nt6.09□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 CLB1YGR108W 1416 nt6.09□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 YMR111CYMR111C 1389 nt6.09□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 HSP104YLL026W 2727 nt6.09□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 PRP40YKL012W 1752 nt6.09□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 PEX7YDR142C 1128 nt6.09□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 CHO1YER026C 831 nt6.09□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt6.09□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 SEC17YBL050W 879 nt6.09□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 PTR2YKR093W 1806 nt6.09□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt6.08□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 YNL228WYNL228W 777 nt6.08□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 NHP6AYPR052C 282 nt6.08□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 NOT3YIL038C 2511 nt6.08□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 YFL034WYFL034W 3222 nt6.08□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 CRZ1YNL027W 2037 nt6.08□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 SER33YIL074C 1410 nt6.08□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 EMP46YLR080W 1335 nt6.07□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 GEX1YCL073C 1848 nt6.07□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt6.07□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 ARP1YHR129C 1155 nt6.07□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 YNL108CYNL108C 813 nt6.07□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 PSH1YOL054W 1221 nt6.07□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 ELC1YPL046C 300 nt6.07□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 ASH1YKL185W 1767 nt6.07□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 TDA6YPR157W 1404 nt6.07□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 TEL2YGR099W 2067 nt6.06□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 CDS1YBR029C 1374 nt6.06□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 RBA50YDR527W 1320 nt6.06□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 RPT4YOR259C 1314 nt6.06□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 SEH1YGL100W 1050 nt6.06□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 FAU1YER183C 636 nt6.05□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 LEM3YNL323W 1245 nt6.05□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 KIP2YPL155C 2121 nt6.05□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 RPN6YDL097C 1305 nt6.04□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 PTK2YJR059W 2457 nt6.04□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 AMA1YGR225W 1782 nt6.04□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 ATG20YDL113C 1923 nt6.04□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 SIP2YGL208W 1248 nt6.04□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 ARG8YOL140W 1272 nt6.04□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 FOB1YDR110W 1701 nt6.04□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 RNR3YIL066C 2610 nt6.04□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 YLH47YPR125W 1365 nt6.04□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 QDR1YIL120W 1692 nt6.04□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 YFL042CYFL042C 2025 nt6.03□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 SRG1SRG1 551 nt6.03□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 YNG2YHR090C 849 nt6.03□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 MND2YIR025W 1107 nt6.03□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 YLR122CYLR122C 378 nt6.03□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 RRT2YBR246W 1164 nt6.03□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 MRC1YCL061C 3291 nt6.03□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 TKL1YPR074C 2043 nt6.03□□□□□ -1.44
SYF1Q04048 SCS2YER120W 735 nt6.02□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 CDC43YGL155W 1131 nt6.02□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 NAG1YGR031C-A 492 nt6.02□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 COX18YGR062C 951 nt6.02□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 KRE9YJL174W 831 nt6.02□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt6.02□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 RHO4YKR055W 876 nt6.02□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 TAF11YML015C 1041 nt6.02□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 MRP51YPL118W 1035 nt6.02□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 URA7YBL039C 1740 nt6.02□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 VMA13YPR036W 1437 nt6.01□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 PGA2YNL149C 390 nt6.01□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 RPL21BYPL079W 483 nt6.01□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 NUP1YOR098C 3231 nt6.01□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 AIM10YER087W 1731 nt6.01□□□□□ -1.45
SYF1Q04048 SUB2YDL084W 1341 nt6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms