Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAV1Q03135 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAV1Q03135 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAV1Q03135 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAV1Q03135 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms