Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYP4A11Q02928 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYP4A11Q02928 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4A11Q02928 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4A11Q02928 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4A11Q02928 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4A11Q02928 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4A11Q02928 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4A11Q02928 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYP4A11Q02928 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYP4A11Q02928 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms