Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BNC1Q01954 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BNC1Q01954 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms